Protein–RNA interactions for Protein: Q91W50

Csde1, Cold shock domain-containing protein E1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csde1Q91W50 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Csde1Q91W50 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms