Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE97

Srsf4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf4Q8VE97 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Srsf4Q8VE97 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Srsf4Q8VE97 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms