Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS8

Stx18, Syntaxin-18, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx18Q8VDS8 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Stx18Q8VDS8 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
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