Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDS4

Rprd1a, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1aQ8VDS4 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rprd1aQ8VDS4 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms