Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDF2

Uhrf1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1Q8VDF2 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Uhrf1Q8VDF2 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Uhrf1Q8VDF2 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Uhrf1Q8VDF2 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Uhrf1Q8VDF2 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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