Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDC1

Fyco1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fyco1Q8VDC1 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fyco1Q8VDC1 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fyco1Q8VDC1 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fyco1Q8VDC1 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fyco1Q8VDC1 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fyco1Q8VDC1 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fyco1Q8VDC1 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fyco1Q8VDC1 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fyco1Q8VDC1 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fyco1Q8VDC1 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fyco1Q8VDC1 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fyco1Q8VDC1 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Fyco1Q8VDC1 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fyco1Q8VDC1 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fyco1Q8VDC1 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fyco1Q8VDC1 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fyco1Q8VDC1 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fyco1Q8VDC1 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fyco1Q8VDC1 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fyco1Q8VDC1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fyco1Q8VDC1 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fyco1Q8VDC1 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fyco1Q8VDC1 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fyco1Q8VDC1 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fyco1Q8VDC1 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fyco1Q8VDC1 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Fyco1Q8VDC1 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fyco1Q8VDC1 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fyco1Q8VDC1 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fyco1Q8VDC1 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fyco1Q8VDC1 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fyco1Q8VDC1 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Fyco1Q8VDC1 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fyco1Q8VDC1 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fyco1Q8VDC1 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fyco1Q8VDC1 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fyco1Q8VDC1 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fyco1Q8VDC1 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fyco1Q8VDC1 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fyco1Q8VDC1 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fyco1Q8VDC1 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fyco1Q8VDC1 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fyco1Q8VDC1 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fyco1Q8VDC1 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fyco1Q8VDC1 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fyco1Q8VDC1 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fyco1Q8VDC1 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fyco1Q8VDC1 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fyco1Q8VDC1 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fyco1Q8VDC1 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fyco1Q8VDC1 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fyco1Q8VDC1 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fyco1Q8VDC1 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fyco1Q8VDC1 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Fyco1Q8VDC1 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fyco1Q8VDC1 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fyco1Q8VDC1 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fyco1Q8VDC1 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fyco1Q8VDC1 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fyco1Q8VDC1 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fyco1Q8VDC1 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fyco1Q8VDC1 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fyco1Q8VDC1 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fyco1Q8VDC1 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fyco1Q8VDC1 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fyco1Q8VDC1 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fyco1Q8VDC1 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fyco1Q8VDC1 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fyco1Q8VDC1 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fyco1Q8VDC1 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fyco1Q8VDC1 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fyco1Q8VDC1 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fyco1Q8VDC1 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Fyco1Q8VDC1 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Fyco1Q8VDC1 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fyco1Q8VDC1 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fyco1Q8VDC1 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Fyco1Q8VDC1 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fyco1Q8VDC1 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fyco1Q8VDC1 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Fyco1Q8VDC1 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Fyco1Q8VDC1 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fyco1Q8VDC1 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fyco1Q8VDC1 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fyco1Q8VDC1 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fyco1Q8VDC1 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fyco1Q8VDC1 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fyco1Q8VDC1 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Fyco1Q8VDC1 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fyco1Q8VDC1 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fyco1Q8VDC1 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fyco1Q8VDC1 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Fyco1Q8VDC1 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fyco1Q8VDC1 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fyco1Q8VDC1 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fyco1Q8VDC1 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fyco1Q8VDC1 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fyco1Q8VDC1 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Fyco1Q8VDC1 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fyco1Q8VDC1 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms