Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE1

Dnajc28, DnaJ homolog subfamily C member 28, mousemouse

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc28Q8VCE1 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Dnajc28Q8VCE1 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Dnajc28Q8VCE1 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnajc28Q8VCE1 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnajc28Q8VCE1 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnajc28Q8VCE1 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Dnajc28Q8VCE1 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnajc28Q8VCE1 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnajc28Q8VCE1 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnajc28Q8VCE1 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnajc28Q8VCE1 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnajc28Q8VCE1 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dnajc28Q8VCE1 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Dnajc28Q8VCE1 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnajc28Q8VCE1 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Dnajc28Q8VCE1 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnajc28Q8VCE1 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dnajc28Q8VCE1 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Dnajc28Q8VCE1 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Dnajc28Q8VCE1 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Dnajc28Q8VCE1 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Dnajc28Q8VCE1 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Dnajc28Q8VCE1 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Dnajc28Q8VCE1 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Dnajc28Q8VCE1 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnajc28Q8VCE1 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnajc28Q8VCE1 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnajc28Q8VCE1 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnajc28Q8VCE1 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnajc28Q8VCE1 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnajc28Q8VCE1 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnajc28Q8VCE1 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnajc28Q8VCE1 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnajc28Q8VCE1 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnajc28Q8VCE1 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnajc28Q8VCE1 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnajc28Q8VCE1 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Dnajc28Q8VCE1 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Dnajc28Q8VCE1 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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