Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT0

Tmx1, Thioredoxin-related transmembrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmx1Q8VBT0 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmx1Q8VBT0 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmx1Q8VBT0 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmx1Q8VBT0 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmx1Q8VBT0 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmx1Q8VBT0 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmx1Q8VBT0 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmx1Q8VBT0 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmx1Q8VBT0 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmx1Q8VBT0 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmx1Q8VBT0 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmx1Q8VBT0 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmx1Q8VBT0 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmx1Q8VBT0 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmx1Q8VBT0 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmx1Q8VBT0 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmx1Q8VBT0 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmx1Q8VBT0 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmx1Q8VBT0 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmx1Q8VBT0 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmx1Q8VBT0 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Tmx1Q8VBT0 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmx1Q8VBT0 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmx1Q8VBT0 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmx1Q8VBT0 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmx1Q8VBT0 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmx1Q8VBT0 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmx1Q8VBT0 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmx1Q8VBT0 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmx1Q8VBT0 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmx1Q8VBT0 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmx1Q8VBT0 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmx1Q8VBT0 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmx1Q8VBT0 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmx1Q8VBT0 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmx1Q8VBT0 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmx1Q8VBT0 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmx1Q8VBT0 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmx1Q8VBT0 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmx1Q8VBT0 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmx1Q8VBT0 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmx1Q8VBT0 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmx1Q8VBT0 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmx1Q8VBT0 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmx1Q8VBT0 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmx1Q8VBT0 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmx1Q8VBT0 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmx1Q8VBT0 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmx1Q8VBT0 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmx1Q8VBT0 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmx1Q8VBT0 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Tmx1Q8VBT0 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmx1Q8VBT0 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmx1Q8VBT0 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmx1Q8VBT0 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmx1Q8VBT0 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmx1Q8VBT0 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmx1Q8VBT0 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmx1Q8VBT0 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmx1Q8VBT0 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmx1Q8VBT0 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmx1Q8VBT0 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmx1Q8VBT0 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmx1Q8VBT0 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmx1Q8VBT0 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmx1Q8VBT0 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmx1Q8VBT0 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmx1Q8VBT0 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmx1Q8VBT0 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmx1Q8VBT0 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmx1Q8VBT0 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmx1Q8VBT0 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmx1Q8VBT0 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmx1Q8VBT0 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmx1Q8VBT0 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmx1Q8VBT0 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmx1Q8VBT0 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmx1Q8VBT0 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmx1Q8VBT0 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmx1Q8VBT0 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmx1Q8VBT0 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmx1Q8VBT0 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmx1Q8VBT0 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmx1Q8VBT0 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmx1Q8VBT0 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmx1Q8VBT0 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmx1Q8VBT0 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmx1Q8VBT0 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmx1Q8VBT0 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmx1Q8VBT0 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmx1Q8VBT0 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmx1Q8VBT0 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmx1Q8VBT0 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmx1Q8VBT0 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmx1Q8VBT0 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmx1Q8VBT0 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmx1Q8VBT0 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmx1Q8VBT0 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmx1Q8VBT0 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmx1Q8VBT0 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms