Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

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Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxc12Q8K5B8 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxc12Q8K5B8 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxc12Q8K5B8 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxc12Q8K5B8 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxc12Q8K5B8 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxc12Q8K5B8 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxc12Q8K5B8 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxc12Q8K5B8 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxc12Q8K5B8 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxc12Q8K5B8 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxc12Q8K5B8 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxc12Q8K5B8 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxc12Q8K5B8 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxc12Q8K5B8 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxc12Q8K5B8 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxc12Q8K5B8 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxc12Q8K5B8 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxc12Q8K5B8 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Hoxc12Q8K5B8 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxc12Q8K5B8 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxc12Q8K5B8 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxc12Q8K5B8 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxc12Q8K5B8 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxc12Q8K5B8 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxc12Q8K5B8 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxc12Q8K5B8 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxc12Q8K5B8 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxc12Q8K5B8 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxc12Q8K5B8 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxc12Q8K5B8 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxc12Q8K5B8 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxc12Q8K5B8 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxc12Q8K5B8 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxc12Q8K5B8 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxc12Q8K5B8 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxc12Q8K5B8 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxc12Q8K5B8 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxc12Q8K5B8 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxc12Q8K5B8 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxc12Q8K5B8 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxc12Q8K5B8 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxc12Q8K5B8 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxc12Q8K5B8 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxc12Q8K5B8 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxc12Q8K5B8 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxc12Q8K5B8 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxc12Q8K5B8 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxc12Q8K5B8 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxc12Q8K5B8 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxc12Q8K5B8 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxc12Q8K5B8 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxc12Q8K5B8 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxc12Q8K5B8 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxc12Q8K5B8 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxc12Q8K5B8 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxc12Q8K5B8 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxc12Q8K5B8 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxc12Q8K5B8 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Hoxc12Q8K5B8 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxc12Q8K5B8 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxc12Q8K5B8 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxc12Q8K5B8 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxc12Q8K5B8 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxc12Q8K5B8 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxc12Q8K5B8 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxc12Q8K5B8 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxc12Q8K5B8 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxc12Q8K5B8 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxc12Q8K5B8 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxc12Q8K5B8 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxc12Q8K5B8 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxc12Q8K5B8 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxc12Q8K5B8 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxc12Q8K5B8 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxc12Q8K5B8 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxc12Q8K5B8 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxc12Q8K5B8 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxc12Q8K5B8 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxc12Q8K5B8 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxc12Q8K5B8 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxc12Q8K5B8 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxc12Q8K5B8 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxc12Q8K5B8 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxc12Q8K5B8 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxc12Q8K5B8 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxc12Q8K5B8 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxc12Q8K5B8 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxc12Q8K5B8 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxc12Q8K5B8 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxc12Q8K5B8 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxc12Q8K5B8 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxc12Q8K5B8 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxc12Q8K5B8 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxc12Q8K5B8 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxc12Q8K5B8 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxc12Q8K5B8 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxc12Q8K5B8 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxc12Q8K5B8 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Hoxc12Q8K5B8 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
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