Protein–RNA interactions for Protein: Q8K424

Trpv3, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 3, mousemouse

Predictions only

Length 791 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv3Q8K424 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trpv3Q8K424 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trpv3Q8K424 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trpv3Q8K424 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trpv3Q8K424 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trpv3Q8K424 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trpv3Q8K424 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trpv3Q8K424 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trpv3Q8K424 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trpv3Q8K424 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trpv3Q8K424 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trpv3Q8K424 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trpv3Q8K424 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trpv3Q8K424 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trpv3Q8K424 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trpv3Q8K424 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trpv3Q8K424 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trpv3Q8K424 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trpv3Q8K424 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trpv3Q8K424 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trpv3Q8K424 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trpv3Q8K424 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trpv3Q8K424 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trpv3Q8K424 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Trpv3Q8K424 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trpv3Q8K424 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trpv3Q8K424 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trpv3Q8K424 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trpv3Q8K424 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trpv3Q8K424 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trpv3Q8K424 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trpv3Q8K424 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trpv3Q8K424 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trpv3Q8K424 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trpv3Q8K424 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trpv3Q8K424 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trpv3Q8K424 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trpv3Q8K424 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trpv3Q8K424 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trpv3Q8K424 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Trpv3Q8K424 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trpv3Q8K424 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trpv3Q8K424 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trpv3Q8K424 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trpv3Q8K424 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trpv3Q8K424 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trpv3Q8K424 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trpv3Q8K424 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trpv3Q8K424 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trpv3Q8K424 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trpv3Q8K424 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trpv3Q8K424 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trpv3Q8K424 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trpv3Q8K424 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trpv3Q8K424 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trpv3Q8K424 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trpv3Q8K424 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trpv3Q8K424 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trpv3Q8K424 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trpv3Q8K424 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trpv3Q8K424 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trpv3Q8K424 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trpv3Q8K424 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trpv3Q8K424 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trpv3Q8K424 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trpv3Q8K424 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trpv3Q8K424 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trpv3Q8K424 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trpv3Q8K424 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trpv3Q8K424 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trpv3Q8K424 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trpv3Q8K424 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trpv3Q8K424 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Trpv3Q8K424 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trpv3Q8K424 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trpv3Q8K424 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trpv3Q8K424 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trpv3Q8K424 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Trpv3Q8K424 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trpv3Q8K424 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trpv3Q8K424 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trpv3Q8K424 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trpv3Q8K424 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trpv3Q8K424 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trpv3Q8K424 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trpv3Q8K424 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trpv3Q8K424 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trpv3Q8K424 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trpv3Q8K424 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trpv3Q8K424 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trpv3Q8K424 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trpv3Q8K424 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trpv3Q8K424 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trpv3Q8K424 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trpv3Q8K424 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trpv3Q8K424 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trpv3Q8K424 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trpv3Q8K424 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trpv3Q8K424 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trpv3Q8K424 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms