Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
OptnQ8K3K8 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
OptnQ8K3K8 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
OptnQ8K3K8 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
OptnQ8K3K8 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms