Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Brd3Q8K2F0 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Brd3Q8K2F0 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms