Protein–RNA interactions for Protein: Q8K243

Trim68, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM68, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim68Q8K243 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Trim68Q8K243 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
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Trim68Q8K243 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Trim68Q8K243 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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