Protein–RNA interactions for Protein: Q8K194

Snrnp27, U4/U6.U5 small nuclear ribonucleoprotein 27 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp27Q8K194 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snrnp27Q8K194 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snrnp27Q8K194 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snrnp27Q8K194 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Snrnp27Q8K194 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snrnp27Q8K194 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snrnp27Q8K194 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snrnp27Q8K194 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snrnp27Q8K194 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snrnp27Q8K194 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snrnp27Q8K194 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snrnp27Q8K194 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snrnp27Q8K194 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snrnp27Q8K194 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snrnp27Q8K194 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snrnp27Q8K194 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snrnp27Q8K194 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snrnp27Q8K194 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snrnp27Q8K194 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snrnp27Q8K194 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snrnp27Q8K194 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Snrnp27Q8K194 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Snrnp27Q8K194 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snrnp27Q8K194 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snrnp27Q8K194 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snrnp27Q8K194 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snrnp27Q8K194 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Snrnp27Q8K194 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snrnp27Q8K194 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snrnp27Q8K194 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snrnp27Q8K194 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snrnp27Q8K194 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Snrnp27Q8K194 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snrnp27Q8K194 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snrnp27Q8K194 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snrnp27Q8K194 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snrnp27Q8K194 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snrnp27Q8K194 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snrnp27Q8K194 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snrnp27Q8K194 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snrnp27Q8K194 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snrnp27Q8K194 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snrnp27Q8K194 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snrnp27Q8K194 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snrnp27Q8K194 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snrnp27Q8K194 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snrnp27Q8K194 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Snrnp27Q8K194 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snrnp27Q8K194 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snrnp27Q8K194 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snrnp27Q8K194 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snrnp27Q8K194 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snrnp27Q8K194 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snrnp27Q8K194 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snrnp27Q8K194 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snrnp27Q8K194 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snrnp27Q8K194 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snrnp27Q8K194 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Snrnp27Q8K194 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snrnp27Q8K194 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snrnp27Q8K194 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snrnp27Q8K194 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snrnp27Q8K194 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snrnp27Q8K194 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snrnp27Q8K194 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snrnp27Q8K194 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snrnp27Q8K194 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snrnp27Q8K194 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snrnp27Q8K194 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snrnp27Q8K194 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snrnp27Q8K194 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snrnp27Q8K194 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Snrnp27Q8K194 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snrnp27Q8K194 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snrnp27Q8K194 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snrnp27Q8K194 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snrnp27Q8K194 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snrnp27Q8K194 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snrnp27Q8K194 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snrnp27Q8K194 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snrnp27Q8K194 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snrnp27Q8K194 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snrnp27Q8K194 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Snrnp27Q8K194 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snrnp27Q8K194 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snrnp27Q8K194 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snrnp27Q8K194 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snrnp27Q8K194 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snrnp27Q8K194 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snrnp27Q8K194 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snrnp27Q8K194 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snrnp27Q8K194 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snrnp27Q8K194 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Snrnp27Q8K194 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snrnp27Q8K194 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snrnp27Q8K194 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snrnp27Q8K194 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Snrnp27Q8K194 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snrnp27Q8K194 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Snrnp27Q8K194 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms