Protein–RNA interactions for Protein: Q8K158

Cnppd1, Protein CNPPD1, mousemouse

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Length 407 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnppd1Q8K158 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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Cnppd1Q8K158 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Cnppd1Q8K158 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
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Cnppd1Q8K158 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Cnppd1Q8K158 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms