Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW8

Pnma3, Paraneoplastic antigen Ma3 homolog, mousemouse

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Length 466 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma3Q8JZW8 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pnma3Q8JZW8 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pnma3Q8JZW8 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pnma3Q8JZW8 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pnma3Q8JZW8 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pnma3Q8JZW8 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pnma3Q8JZW8 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pnma3Q8JZW8 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pnma3Q8JZW8 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pnma3Q8JZW8 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pnma3Q8JZW8 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pnma3Q8JZW8 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pnma3Q8JZW8 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pnma3Q8JZW8 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Pnma3Q8JZW8 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pnma3Q8JZW8 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pnma3Q8JZW8 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pnma3Q8JZW8 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pnma3Q8JZW8 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pnma3Q8JZW8 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Pnma3Q8JZW8 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pnma3Q8JZW8 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pnma3Q8JZW8 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Pnma3Q8JZW8 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pnma3Q8JZW8 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Pnma3Q8JZW8 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pnma3Q8JZW8 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pnma3Q8JZW8 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pnma3Q8JZW8 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pnma3Q8JZW8 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pnma3Q8JZW8 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Pnma3Q8JZW8 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pnma3Q8JZW8 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pnma3Q8JZW8 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pnma3Q8JZW8 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pnma3Q8JZW8 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pnma3Q8JZW8 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pnma3Q8JZW8 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pnma3Q8JZW8 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pnma3Q8JZW8 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Pnma3Q8JZW8 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pnma3Q8JZW8 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pnma3Q8JZW8 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pnma3Q8JZW8 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pnma3Q8JZW8 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pnma3Q8JZW8 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pnma3Q8JZW8 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pnma3Q8JZW8 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pnma3Q8JZW8 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pnma3Q8JZW8 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pnma3Q8JZW8 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pnma3Q8JZW8 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pnma3Q8JZW8 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pnma3Q8JZW8 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pnma3Q8JZW8 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pnma3Q8JZW8 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pnma3Q8JZW8 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pnma3Q8JZW8 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pnma3Q8JZW8 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pnma3Q8JZW8 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pnma3Q8JZW8 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pnma3Q8JZW8 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pnma3Q8JZW8 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pnma3Q8JZW8 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pnma3Q8JZW8 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pnma3Q8JZW8 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pnma3Q8JZW8 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Pnma3Q8JZW8 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pnma3Q8JZW8 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pnma3Q8JZW8 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pnma3Q8JZW8 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pnma3Q8JZW8 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pnma3Q8JZW8 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pnma3Q8JZW8 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pnma3Q8JZW8 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pnma3Q8JZW8 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pnma3Q8JZW8 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pnma3Q8JZW8 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pnma3Q8JZW8 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pnma3Q8JZW8 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pnma3Q8JZW8 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pnma3Q8JZW8 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pnma3Q8JZW8 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pnma3Q8JZW8 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pnma3Q8JZW8 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pnma3Q8JZW8 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pnma3Q8JZW8 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pnma3Q8JZW8 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pnma3Q8JZW8 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pnma3Q8JZW8 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pnma3Q8JZW8 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pnma3Q8JZW8 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pnma3Q8JZW8 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pnma3Q8JZW8 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pnma3Q8JZW8 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pnma3Q8JZW8 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pnma3Q8JZW8 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pnma3Q8JZW8 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pnma3Q8JZW8 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pnma3Q8JZW8 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms