Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIE6

Copa, Coatomer subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopaQ8CIE6 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CopaQ8CIE6 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CopaQ8CIE6 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CopaQ8CIE6 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CopaQ8CIE6 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CopaQ8CIE6 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CopaQ8CIE6 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CopaQ8CIE6 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CopaQ8CIE6 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CopaQ8CIE6 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CopaQ8CIE6 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CopaQ8CIE6 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CopaQ8CIE6 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CopaQ8CIE6 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CopaQ8CIE6 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CopaQ8CIE6 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CopaQ8CIE6 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CopaQ8CIE6 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CopaQ8CIE6 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CopaQ8CIE6 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CopaQ8CIE6 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CopaQ8CIE6 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CopaQ8CIE6 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CopaQ8CIE6 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CopaQ8CIE6 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CopaQ8CIE6 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CopaQ8CIE6 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CopaQ8CIE6 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CopaQ8CIE6 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CopaQ8CIE6 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CopaQ8CIE6 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CopaQ8CIE6 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CopaQ8CIE6 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CopaQ8CIE6 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CopaQ8CIE6 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CopaQ8CIE6 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CopaQ8CIE6 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CopaQ8CIE6 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CopaQ8CIE6 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CopaQ8CIE6 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CopaQ8CIE6 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CopaQ8CIE6 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CopaQ8CIE6 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CopaQ8CIE6 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CopaQ8CIE6 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CopaQ8CIE6 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CopaQ8CIE6 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CopaQ8CIE6 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CopaQ8CIE6 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CopaQ8CIE6 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CopaQ8CIE6 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CopaQ8CIE6 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CopaQ8CIE6 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CopaQ8CIE6 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CopaQ8CIE6 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CopaQ8CIE6 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CopaQ8CIE6 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CopaQ8CIE6 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CopaQ8CIE6 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CopaQ8CIE6 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CopaQ8CIE6 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CopaQ8CIE6 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CopaQ8CIE6 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CopaQ8CIE6 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CopaQ8CIE6 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CopaQ8CIE6 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CopaQ8CIE6 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CopaQ8CIE6 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CopaQ8CIE6 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CopaQ8CIE6 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CopaQ8CIE6 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CopaQ8CIE6 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CopaQ8CIE6 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CopaQ8CIE6 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CopaQ8CIE6 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CopaQ8CIE6 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CopaQ8CIE6 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CopaQ8CIE6 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CopaQ8CIE6 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CopaQ8CIE6 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CopaQ8CIE6 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
CopaQ8CIE6 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CopaQ8CIE6 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CopaQ8CIE6 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CopaQ8CIE6 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CopaQ8CIE6 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CopaQ8CIE6 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CopaQ8CIE6 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CopaQ8CIE6 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CopaQ8CIE6 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CopaQ8CIE6 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms