Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Hpf1Q8CFE2 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms