Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEJ8

Gm9955, Predicted gene 9955 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9955Q8CEJ8 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm9955Q8CEJ8 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.31□□□□□ -1.24
Gm9955Q8CEJ8 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm9955Q8CEJ8 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm9955Q8CEJ8 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm9955Q8CEJ8 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm9955Q8CEJ8 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm9955Q8CEJ8 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm9955Q8CEJ8 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm9955Q8CEJ8 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm9955Q8CEJ8 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm9955Q8CEJ8 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm9955Q8CEJ8 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm9955Q8CEJ8 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm9955Q8CEJ8 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm9955Q8CEJ8 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm9955Q8CEJ8 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm9955Q8CEJ8 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
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Gm9955Q8CEJ8 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm9955Q8CEJ8 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm9955Q8CEJ8 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm9955Q8CEJ8 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm9955Q8CEJ8 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm9955Q8CEJ8 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm9955Q8CEJ8 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm9955Q8CEJ8 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm9955Q8CEJ8 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm9955Q8CEJ8 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm9955Q8CEJ8 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm9955Q8CEJ8 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
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Gm9955Q8CEJ8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm9955Q8CEJ8 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm9955Q8CEJ8 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm9955Q8CEJ8 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
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Gm9955Q8CEJ8 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm9955Q8CEJ8 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm9955Q8CEJ8 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm9955Q8CEJ8 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm9955Q8CEJ8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm9955Q8CEJ8 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
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Gm9955Q8CEJ8 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm9955Q8CEJ8 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm9955Q8CEJ8 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm9955Q8CEJ8 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
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Gm9955Q8CEJ8 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm9955Q8CEJ8 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm9955Q8CEJ8 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm9955Q8CEJ8 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm9955Q8CEJ8 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
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Gm9955Q8CEJ8 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm9955Q8CEJ8 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
Gm9955Q8CEJ8 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
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Gm9955Q8CEJ8 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
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Gm9955Q8CEJ8 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm9955Q8CEJ8 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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Gm9955Q8CEJ8 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
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Gm9955Q8CEJ8 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm9955Q8CEJ8 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm9955Q8CEJ8 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm9955Q8CEJ8 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm9955Q8CEJ8 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm9955Q8CEJ8 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm9955Q8CEJ8 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm9955Q8CEJ8 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm9955Q8CEJ8 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm9955Q8CEJ8 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm9955Q8CEJ8 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm9955Q8CEJ8 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm9955Q8CEJ8 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm9955Q8CEJ8 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm9955Q8CEJ8 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm9955Q8CEJ8 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm9955Q8CEJ8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
Gm9955Q8CEJ8 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
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