Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc28aQ8CEI3 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc28aQ8CEI3 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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