Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI1

Bola3, BolA-like protein 3, mousemouse

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bola3Q8CEI1 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bola3Q8CEI1 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bola3Q8CEI1 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bola3Q8CEI1 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bola3Q8CEI1 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bola3Q8CEI1 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bola3Q8CEI1 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bola3Q8CEI1 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bola3Q8CEI1 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Bola3Q8CEI1 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bola3Q8CEI1 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bola3Q8CEI1 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bola3Q8CEI1 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Bola3Q8CEI1 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bola3Q8CEI1 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bola3Q8CEI1 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bola3Q8CEI1 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bola3Q8CEI1 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bola3Q8CEI1 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bola3Q8CEI1 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bola3Q8CEI1 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bola3Q8CEI1 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bola3Q8CEI1 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bola3Q8CEI1 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bola3Q8CEI1 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bola3Q8CEI1 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bola3Q8CEI1 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bola3Q8CEI1 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Bola3Q8CEI1 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Bola3Q8CEI1 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bola3Q8CEI1 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bola3Q8CEI1 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Bola3Q8CEI1 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Bola3Q8CEI1 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bola3Q8CEI1 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Bola3Q8CEI1 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bola3Q8CEI1 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Bola3Q8CEI1 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Bola3Q8CEI1 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Bola3Q8CEI1 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bola3Q8CEI1 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bola3Q8CEI1 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
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Bola3Q8CEI1 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bola3Q8CEI1 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bola3Q8CEI1 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bola3Q8CEI1 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Bola3Q8CEI1 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bola3Q8CEI1 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Bola3Q8CEI1 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Bola3Q8CEI1 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Bola3Q8CEI1 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bola3Q8CEI1 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Bola3Q8CEI1 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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Bola3Q8CEI1 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bola3Q8CEI1 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bola3Q8CEI1 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bola3Q8CEI1 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bola3Q8CEI1 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bola3Q8CEI1 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bola3Q8CEI1 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bola3Q8CEI1 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Bola3Q8CEI1 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bola3Q8CEI1 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Bola3Q8CEI1 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Bola3Q8CEI1 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Bola3Q8CEI1 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bola3Q8CEI1 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bola3Q8CEI1 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bola3Q8CEI1 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bola3Q8CEI1 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bola3Q8CEI1 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bola3Q8CEI1 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bola3Q8CEI1 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bola3Q8CEI1 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bola3Q8CEI1 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bola3Q8CEI1 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bola3Q8CEI1 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bola3Q8CEI1 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bola3Q8CEI1 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bola3Q8CEI1 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bola3Q8CEI1 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bola3Q8CEI1 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bola3Q8CEI1 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bola3Q8CEI1 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Bola3Q8CEI1 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bola3Q8CEI1 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bola3Q8CEI1 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bola3Q8CEI1 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Bola3Q8CEI1 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Bola3Q8CEI1 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms