Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN8

Ccdc38, Coiled-coil domain-containing protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc38Q8CDN8 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc38Q8CDN8 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc38Q8CDN8 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc38Q8CDN8 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc38Q8CDN8 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc38Q8CDN8 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc38Q8CDN8 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc38Q8CDN8 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc38Q8CDN8 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc38Q8CDN8 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc38Q8CDN8 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc38Q8CDN8 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc38Q8CDN8 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc38Q8CDN8 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc38Q8CDN8 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc38Q8CDN8 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc38Q8CDN8 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc38Q8CDN8 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc38Q8CDN8 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc38Q8CDN8 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc38Q8CDN8 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc38Q8CDN8 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc38Q8CDN8 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc38Q8CDN8 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc38Q8CDN8 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc38Q8CDN8 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc38Q8CDN8 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc38Q8CDN8 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc38Q8CDN8 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc38Q8CDN8 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc38Q8CDN8 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc38Q8CDN8 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc38Q8CDN8 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc38Q8CDN8 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc38Q8CDN8 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc38Q8CDN8 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc38Q8CDN8 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc38Q8CDN8 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc38Q8CDN8 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc38Q8CDN8 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc38Q8CDN8 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc38Q8CDN8 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc38Q8CDN8 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc38Q8CDN8 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc38Q8CDN8 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc38Q8CDN8 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc38Q8CDN8 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc38Q8CDN8 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc38Q8CDN8 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc38Q8CDN8 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc38Q8CDN8 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ccdc38Q8CDN8 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ccdc38Q8CDN8 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ccdc38Q8CDN8 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms