Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCX5

Krt222, Keratin-like protein KRT222, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt222Q8CCX5 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt222Q8CCX5 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt222Q8CCX5 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt222Q8CCX5 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt222Q8CCX5 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt222Q8CCX5 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt222Q8CCX5 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Krt222Q8CCX5 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt222Q8CCX5 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt222Q8CCX5 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt222Q8CCX5 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt222Q8CCX5 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt222Q8CCX5 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt222Q8CCX5 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt222Q8CCX5 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt222Q8CCX5 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt222Q8CCX5 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt222Q8CCX5 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt222Q8CCX5 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt222Q8CCX5 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt222Q8CCX5 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt222Q8CCX5 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt222Q8CCX5 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt222Q8CCX5 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt222Q8CCX5 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt222Q8CCX5 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt222Q8CCX5 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt222Q8CCX5 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt222Q8CCX5 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt222Q8CCX5 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt222Q8CCX5 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt222Q8CCX5 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt222Q8CCX5 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt222Q8CCX5 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt222Q8CCX5 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt222Q8CCX5 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt222Q8CCX5 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt222Q8CCX5 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt222Q8CCX5 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt222Q8CCX5 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt222Q8CCX5 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt222Q8CCX5 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt222Q8CCX5 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt222Q8CCX5 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt222Q8CCX5 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Krt222Q8CCX5 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt222Q8CCX5 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt222Q8CCX5 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt222Q8CCX5 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt222Q8CCX5 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt222Q8CCX5 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt222Q8CCX5 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt222Q8CCX5 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt222Q8CCX5 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt222Q8CCX5 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt222Q8CCX5 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt222Q8CCX5 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt222Q8CCX5 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt222Q8CCX5 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt222Q8CCX5 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt222Q8CCX5 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt222Q8CCX5 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt222Q8CCX5 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt222Q8CCX5 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt222Q8CCX5 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt222Q8CCX5 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Krt222Q8CCX5 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt222Q8CCX5 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt222Q8CCX5 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt222Q8CCX5 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt222Q8CCX5 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt222Q8CCX5 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt222Q8CCX5 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt222Q8CCX5 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt222Q8CCX5 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt222Q8CCX5 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt222Q8CCX5 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt222Q8CCX5 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt222Q8CCX5 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt222Q8CCX5 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt222Q8CCX5 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt222Q8CCX5 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt222Q8CCX5 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt222Q8CCX5 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt222Q8CCX5 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt222Q8CCX5 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt222Q8CCX5 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt222Q8CCX5 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt222Q8CCX5 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt222Q8CCX5 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt222Q8CCX5 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt222Q8CCX5 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt222Q8CCX5 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt222Q8CCX5 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt222Q8CCX5 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt222Q8CCX5 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt222Q8CCX5 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt222Q8CCX5 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt222Q8CCX5 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Krt222Q8CCX5 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms