Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBY1

Samd4a, Protein Smaug homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd4aQ8CBY1 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Samd4aQ8CBY1 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Samd4aQ8CBY1 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Samd4aQ8CBY1 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Samd4aQ8CBY1 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Samd4aQ8CBY1 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Samd4aQ8CBY1 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Samd4aQ8CBY1 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Samd4aQ8CBY1 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Samd4aQ8CBY1 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Samd4aQ8CBY1 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Samd4aQ8CBY1 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Samd4aQ8CBY1 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Samd4aQ8CBY1 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Samd4aQ8CBY1 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Samd4aQ8CBY1 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Samd4aQ8CBY1 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Samd4aQ8CBY1 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Samd4aQ8CBY1 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samd4aQ8CBY1 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samd4aQ8CBY1 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samd4aQ8CBY1 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samd4aQ8CBY1 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samd4aQ8CBY1 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samd4aQ8CBY1 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samd4aQ8CBY1 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samd4aQ8CBY1 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samd4aQ8CBY1 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samd4aQ8CBY1 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samd4aQ8CBY1 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samd4aQ8CBY1 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samd4aQ8CBY1 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samd4aQ8CBY1 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samd4aQ8CBY1 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samd4aQ8CBY1 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samd4aQ8CBY1 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Samd4aQ8CBY1 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Samd4aQ8CBY1 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samd4aQ8CBY1 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samd4aQ8CBY1 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samd4aQ8CBY1 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Samd4aQ8CBY1 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Samd4aQ8CBY1 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samd4aQ8CBY1 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samd4aQ8CBY1 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samd4aQ8CBY1 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samd4aQ8CBY1 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samd4aQ8CBY1 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samd4aQ8CBY1 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samd4aQ8CBY1 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samd4aQ8CBY1 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samd4aQ8CBY1 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samd4aQ8CBY1 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samd4aQ8CBY1 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samd4aQ8CBY1 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samd4aQ8CBY1 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Samd4aQ8CBY1 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samd4aQ8CBY1 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samd4aQ8CBY1 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samd4aQ8CBY1 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samd4aQ8CBY1 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samd4aQ8CBY1 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samd4aQ8CBY1 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samd4aQ8CBY1 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samd4aQ8CBY1 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samd4aQ8CBY1 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Samd4aQ8CBY1 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samd4aQ8CBY1 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samd4aQ8CBY1 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samd4aQ8CBY1 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samd4aQ8CBY1 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samd4aQ8CBY1 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samd4aQ8CBY1 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samd4aQ8CBY1 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samd4aQ8CBY1 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samd4aQ8CBY1 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samd4aQ8CBY1 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samd4aQ8CBY1 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samd4aQ8CBY1 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samd4aQ8CBY1 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samd4aQ8CBY1 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samd4aQ8CBY1 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samd4aQ8CBY1 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samd4aQ8CBY1 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samd4aQ8CBY1 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samd4aQ8CBY1 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samd4aQ8CBY1 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samd4aQ8CBY1 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samd4aQ8CBY1 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samd4aQ8CBY1 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samd4aQ8CBY1 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Samd4aQ8CBY1 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Samd4aQ8CBY1 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Samd4aQ8CBY1 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Samd4aQ8CBY1 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Samd4aQ8CBY1 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Samd4aQ8CBY1 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Samd4aQ8CBY1 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Samd4aQ8CBY1 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Samd4aQ8CBY1 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
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