Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBA2

Slfn5, Schlafen family member 5, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn5Q8CBA2 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Slfn5Q8CBA2 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slfn5Q8CBA2 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slfn5Q8CBA2 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slfn5Q8CBA2 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slfn5Q8CBA2 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slfn5Q8CBA2 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slfn5Q8CBA2 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slfn5Q8CBA2 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slfn5Q8CBA2 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slfn5Q8CBA2 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Slfn5Q8CBA2 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Slfn5Q8CBA2 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slfn5Q8CBA2 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slfn5Q8CBA2 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slfn5Q8CBA2 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slfn5Q8CBA2 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slfn5Q8CBA2 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slfn5Q8CBA2 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slfn5Q8CBA2 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slfn5Q8CBA2 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slfn5Q8CBA2 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slfn5Q8CBA2 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slfn5Q8CBA2 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slfn5Q8CBA2 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slfn5Q8CBA2 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slfn5Q8CBA2 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slfn5Q8CBA2 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms