Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7N7

Aph1b, Gamma-secretase subunit APH-1B, mousemouse

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Length 257 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aph1bQ8C7N7 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Aph1bQ8C7N7 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Aph1bQ8C7N7 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Aph1bQ8C7N7 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Aph1bQ8C7N7 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Aph1bQ8C7N7 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Aph1bQ8C7N7 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Aph1bQ8C7N7 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Aph1bQ8C7N7 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Aph1bQ8C7N7 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Aph1bQ8C7N7 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Aph1bQ8C7N7 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Aph1bQ8C7N7 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Aph1bQ8C7N7 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Aph1bQ8C7N7 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Aph1bQ8C7N7 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Aph1bQ8C7N7 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Aph1bQ8C7N7 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Aph1bQ8C7N7 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Aph1bQ8C7N7 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Aph1bQ8C7N7 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Aph1bQ8C7N7 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
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Aph1bQ8C7N7 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Aph1bQ8C7N7 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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