Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5V8

Ccdc187, Coiled-coil domain-containing protein 187, mousemouse

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Length 958 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc187Q8C5V8 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Ccdc187Q8C5V8 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc187Q8C5V8 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc187Q8C5V8 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Ccdc187Q8C5V8 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc187Q8C5V8 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Ccdc187Q8C5V8 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc187Q8C5V8 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc187Q8C5V8 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc187Q8C5V8 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc187Q8C5V8 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Ccdc187Q8C5V8 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Ccdc187Q8C5V8 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Ccdc187Q8C5V8 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc187Q8C5V8 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc187Q8C5V8 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Ccdc187Q8C5V8 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc187Q8C5V8 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Ccdc187Q8C5V8 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc187Q8C5V8 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc187Q8C5V8 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc187Q8C5V8 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc187Q8C5V8 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc187Q8C5V8 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc187Q8C5V8 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc187Q8C5V8 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Ccdc187Q8C5V8 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Ccdc187Q8C5V8 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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