Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Gm12697-201ENSMUST00000118008 667 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Gm11655-201ENSMUST00000153899 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Gm18799-201ENSMUST00000189104 913 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Gm28437-201ENSMUST00000190277 783 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Gm30708-201ENSMUST00000202183 312 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 5033423K11Rik-202ENSMUST00000202802 1162 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Gm44237-201ENSMUST00000205183 936 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Olfr209-203ENSMUST00000208875 1194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Ss18l2-205ENSMUST00000215833 479 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim35Q8C006 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 AC116589.5-201ENSMUST00000222230 1660 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 2900092N22Rik-201ENSMUST00000193601 1409 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Gm25414-201ENSMUST00000101814 107 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Gm8922-201ENSMUST00000170057 1167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Trim35Q8C006 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Trim35Q8C006 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Trim35Q8C006 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Olfr1145-201ENSMUST00000079711 945 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Gm42941-201ENSMUST00000200347 1321 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Trim35Q8C006 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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