Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXA6

Cldn17, Claudin-17, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn17Q8BXA6 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cldn17Q8BXA6 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cldn17Q8BXA6 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
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