Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Ctdsp2Q8BX07 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms