Protein–RNA interactions for Protein: Q8BR65

Suds3, Sin3 histone deacetylase corepressor complex component SDS3, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Suds3Q8BR65 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Suds3Q8BR65 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms