Protein–RNA interactions for Protein: Q8BIJ7

Rufy1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 712 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy1Q8BIJ7 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rufy1Q8BIJ7 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms