Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG99

Pknox2, Homeobox protein PKNOX2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pknox2Q8BG99 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pknox2Q8BG99 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pknox2Q8BG99 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pknox2Q8BG99 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pknox2Q8BG99 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Pknox2Q8BG99 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pknox2Q8BG99 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pknox2Q8BG99 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pknox2Q8BG99 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pknox2Q8BG99 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Pknox2Q8BG99 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pknox2Q8BG99 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pknox2Q8BG99 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pknox2Q8BG99 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pknox2Q8BG99 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pknox2Q8BG99 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Pknox2Q8BG99 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pknox2Q8BG99 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pknox2Q8BG99 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pknox2Q8BG99 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pknox2Q8BG99 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pknox2Q8BG99 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pknox2Q8BG99 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pknox2Q8BG99 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pknox2Q8BG99 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pknox2Q8BG99 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pknox2Q8BG99 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pknox2Q8BG99 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pknox2Q8BG99 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pknox2Q8BG99 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pknox2Q8BG99 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pknox2Q8BG99 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pknox2Q8BG99 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pknox2Q8BG99 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pknox2Q8BG99 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Pknox2Q8BG99 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pknox2Q8BG99 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pknox2Q8BG99 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pknox2Q8BG99 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pknox2Q8BG99 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pknox2Q8BG99 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pknox2Q8BG99 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pknox2Q8BG99 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pknox2Q8BG99 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pknox2Q8BG99 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pknox2Q8BG99 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pknox2Q8BG99 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pknox2Q8BG99 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pknox2Q8BG99 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pknox2Q8BG99 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pknox2Q8BG99 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pknox2Q8BG99 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pknox2Q8BG99 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pknox2Q8BG99 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pknox2Q8BG99 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pknox2Q8BG99 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pknox2Q8BG99 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pknox2Q8BG99 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pknox2Q8BG99 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pknox2Q8BG99 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pknox2Q8BG99 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pknox2Q8BG99 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pknox2Q8BG99 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pknox2Q8BG99 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pknox2Q8BG99 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pknox2Q8BG99 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pknox2Q8BG99 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pknox2Q8BG99 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pknox2Q8BG99 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pknox2Q8BG99 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pknox2Q8BG99 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pknox2Q8BG99 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pknox2Q8BG99 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pknox2Q8BG99 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pknox2Q8BG99 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pknox2Q8BG99 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pknox2Q8BG99 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pknox2Q8BG99 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pknox2Q8BG99 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pknox2Q8BG99 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pknox2Q8BG99 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pknox2Q8BG99 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pknox2Q8BG99 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pknox2Q8BG99 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pknox2Q8BG99 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pknox2Q8BG99 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pknox2Q8BG99 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Pknox2Q8BG99 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pknox2Q8BG99 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pknox2Q8BG99 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pknox2Q8BG99 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pknox2Q8BG99 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pknox2Q8BG99 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Pknox2Q8BG99 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pknox2Q8BG99 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pknox2Q8BG99 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Pknox2Q8BG99 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pknox2Q8BG99 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pknox2Q8BG99 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pknox2Q8BG99 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70 ms