Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
H2-M10.4Q85ZW8 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
H2-M10.4Q85ZW8 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms