Protein–RNA interactions for Protein: Q810M6

Liat1, Protein LIAT1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Liat1Q810M6 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Liat1Q810M6 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Liat1Q810M6 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Liat1Q810M6 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Liat1Q810M6 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Liat1Q810M6 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Liat1Q810M6 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Liat1Q810M6 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Liat1Q810M6 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Liat1Q810M6 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Liat1Q810M6 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Liat1Q810M6 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Liat1Q810M6 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Liat1Q810M6 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Liat1Q810M6 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Liat1Q810M6 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Liat1Q810M6 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Liat1Q810M6 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Liat1Q810M6 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Liat1Q810M6 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Liat1Q810M6 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Liat1Q810M6 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Liat1Q810M6 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Liat1Q810M6 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Liat1Q810M6 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Liat1Q810M6 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Liat1Q810M6 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Liat1Q810M6 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Liat1Q810M6 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Liat1Q810M6 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Liat1Q810M6 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Liat1Q810M6 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Liat1Q810M6 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Liat1Q810M6 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Liat1Q810M6 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Liat1Q810M6 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Liat1Q810M6 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Liat1Q810M6 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Liat1Q810M6 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Liat1Q810M6 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Liat1Q810M6 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Liat1Q810M6 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Liat1Q810M6 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Liat1Q810M6 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Liat1Q810M6 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Liat1Q810M6 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Liat1Q810M6 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Liat1Q810M6 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Liat1Q810M6 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Liat1Q810M6 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Liat1Q810M6 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Liat1Q810M6 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Liat1Q810M6 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Liat1Q810M6 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Liat1Q810M6 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Liat1Q810M6 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Liat1Q810M6 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Liat1Q810M6 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Liat1Q810M6 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Liat1Q810M6 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Liat1Q810M6 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Liat1Q810M6 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Liat1Q810M6 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Liat1Q810M6 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Liat1Q810M6 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Liat1Q810M6 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Liat1Q810M6 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Liat1Q810M6 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Liat1Q810M6 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Liat1Q810M6 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Liat1Q810M6 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Liat1Q810M6 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Liat1Q810M6 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Liat1Q810M6 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Liat1Q810M6 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Liat1Q810M6 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Liat1Q810M6 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Liat1Q810M6 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Liat1Q810M6 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Liat1Q810M6 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Liat1Q810M6 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Liat1Q810M6 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Liat1Q810M6 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Liat1Q810M6 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Liat1Q810M6 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Liat1Q810M6 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Liat1Q810M6 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Liat1Q810M6 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Liat1Q810M6 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Liat1Q810M6 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Liat1Q810M6 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Liat1Q810M6 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Liat1Q810M6 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Liat1Q810M6 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Liat1Q810M6 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Liat1Q810M6 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Liat1Q810M6 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Liat1Q810M6 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Liat1Q810M6 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Liat1Q810M6 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms