Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z25

Ofd1, Oral-facial-digital syndrome 1 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ofd1Q80Z25 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ofd1Q80Z25 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ofd1Q80Z25 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Ofd1Q80Z25 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ofd1Q80Z25 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ofd1Q80Z25 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ofd1Q80Z25 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ofd1Q80Z25 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ofd1Q80Z25 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ofd1Q80Z25 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ofd1Q80Z25 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ofd1Q80Z25 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ofd1Q80Z25 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ofd1Q80Z25 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ofd1Q80Z25 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ofd1Q80Z25 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ofd1Q80Z25 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ofd1Q80Z25 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ofd1Q80Z25 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ofd1Q80Z25 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ofd1Q80Z25 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ofd1Q80Z25 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ofd1Q80Z25 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ofd1Q80Z25 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ofd1Q80Z25 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ofd1Q80Z25 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ofd1Q80Z25 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ofd1Q80Z25 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ofd1Q80Z25 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ofd1Q80Z25 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ofd1Q80Z25 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ofd1Q80Z25 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Ofd1Q80Z25 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ofd1Q80Z25 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ofd1Q80Z25 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ofd1Q80Z25 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ofd1Q80Z25 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ofd1Q80Z25 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ofd1Q80Z25 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ofd1Q80Z25 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ofd1Q80Z25 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ofd1Q80Z25 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ofd1Q80Z25 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ofd1Q80Z25 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ofd1Q80Z25 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ofd1Q80Z25 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ofd1Q80Z25 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ofd1Q80Z25 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ofd1Q80Z25 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ofd1Q80Z25 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ofd1Q80Z25 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ofd1Q80Z25 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ofd1Q80Z25 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ofd1Q80Z25 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ofd1Q80Z25 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ofd1Q80Z25 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ofd1Q80Z25 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ofd1Q80Z25 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Ofd1Q80Z25 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ofd1Q80Z25 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ofd1Q80Z25 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ofd1Q80Z25 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
Ofd1Q80Z25 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ofd1Q80Z25 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ofd1Q80Z25 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ofd1Q80Z25 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ofd1Q80Z25 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ofd1Q80Z25 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ofd1Q80Z25 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ofd1Q80Z25 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ofd1Q80Z25 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ofd1Q80Z25 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ofd1Q80Z25 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ofd1Q80Z25 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ofd1Q80Z25 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ofd1Q80Z25 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ofd1Q80Z25 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ofd1Q80Z25 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ofd1Q80Z25 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ofd1Q80Z25 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ofd1Q80Z25 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ofd1Q80Z25 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ofd1Q80Z25 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ofd1Q80Z25 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ofd1Q80Z25 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ofd1Q80Z25 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ofd1Q80Z25 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ofd1Q80Z25 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ofd1Q80Z25 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ofd1Q80Z25 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ofd1Q80Z25 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ofd1Q80Z25 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ofd1Q80Z25 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ofd1Q80Z25 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ofd1Q80Z25 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ofd1Q80Z25 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ofd1Q80Z25 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ofd1Q80Z25 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ofd1Q80Z25 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ofd1Q80Z25 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms