Protein–RNA interactions for Protein: Q80XU8

Lrfn4, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrfn4Q80XU8 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Lrfn4Q80XU8 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Lrfn4Q80XU8 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrfn4Q80XU8 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrfn4Q80XU8 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrfn4Q80XU8 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrfn4Q80XU8 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrfn4Q80XU8 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lrfn4Q80XU8 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms