Protein–RNA interactions for Protein: Q80XD1

Chn2, Beta-chimaerin, mousemouse

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Length 332 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chn2Q80XD1 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Chn2Q80XD1 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chn2Q80XD1 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chn2Q80XD1 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chn2Q80XD1 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chn2Q80XD1 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Chn2Q80XD1 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chn2Q80XD1 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chn2Q80XD1 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Chn2Q80XD1 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chn2Q80XD1 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Chn2Q80XD1 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Chn2Q80XD1 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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