Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSN2

Clm, CMRF35-like molecule, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmQ7TSN2 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Olfr282-203ENSMUST00000213608 1374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Gm44251-201ENSMUST00000204963 442 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Gm39375-201ENSMUST00000217068 1039 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Gm5797-201ENSMUST00000100886 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Gm3476-201ENSMUST00000112742 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Gm3149-201ENSMUST00000112779 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Gm8362-202ENSMUST00000170673 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 AC153361.2-203ENSMUST00000218083 661 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
ClmQ7TSN2 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms