Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Tnfsf18Q7TS55 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms