Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNL3

Stk40, Serine/threonine-protein kinase 40, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stk40Q7TNL3 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stk40Q7TNL3 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stk40Q7TNL3 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stk40Q7TNL3 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stk40Q7TNL3 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stk40Q7TNL3 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Stk40Q7TNL3 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stk40Q7TNL3 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stk40Q7TNL3 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stk40Q7TNL3 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stk40Q7TNL3 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stk40Q7TNL3 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stk40Q7TNL3 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stk40Q7TNL3 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stk40Q7TNL3 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stk40Q7TNL3 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stk40Q7TNL3 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stk40Q7TNL3 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stk40Q7TNL3 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stk40Q7TNL3 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stk40Q7TNL3 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stk40Q7TNL3 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stk40Q7TNL3 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stk40Q7TNL3 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stk40Q7TNL3 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Stk40Q7TNL3 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stk40Q7TNL3 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stk40Q7TNL3 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stk40Q7TNL3 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stk40Q7TNL3 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stk40Q7TNL3 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stk40Q7TNL3 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Stk40Q7TNL3 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stk40Q7TNL3 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stk40Q7TNL3 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stk40Q7TNL3 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stk40Q7TNL3 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stk40Q7TNL3 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stk40Q7TNL3 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stk40Q7TNL3 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stk40Q7TNL3 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stk40Q7TNL3 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stk40Q7TNL3 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stk40Q7TNL3 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stk40Q7TNL3 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Stk40Q7TNL3 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stk40Q7TNL3 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stk40Q7TNL3 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stk40Q7TNL3 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stk40Q7TNL3 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stk40Q7TNL3 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stk40Q7TNL3 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stk40Q7TNL3 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stk40Q7TNL3 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stk40Q7TNL3 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stk40Q7TNL3 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stk40Q7TNL3 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stk40Q7TNL3 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stk40Q7TNL3 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stk40Q7TNL3 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stk40Q7TNL3 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stk40Q7TNL3 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stk40Q7TNL3 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stk40Q7TNL3 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stk40Q7TNL3 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stk40Q7TNL3 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stk40Q7TNL3 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stk40Q7TNL3 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stk40Q7TNL3 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stk40Q7TNL3 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Stk40Q7TNL3 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stk40Q7TNL3 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stk40Q7TNL3 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stk40Q7TNL3 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stk40Q7TNL3 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stk40Q7TNL3 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stk40Q7TNL3 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stk40Q7TNL3 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stk40Q7TNL3 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stk40Q7TNL3 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stk40Q7TNL3 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stk40Q7TNL3 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stk40Q7TNL3 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stk40Q7TNL3 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stk40Q7TNL3 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Stk40Q7TNL3 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Stk40Q7TNL3 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Stk40Q7TNL3 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Stk40Q7TNL3 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Stk40Q7TNL3 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stk40Q7TNL3 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stk40Q7TNL3 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stk40Q7TNL3 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Stk40Q7TNL3 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stk40Q7TNL3 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stk40Q7TNL3 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stk40Q7TNL3 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stk40Q7TNL3 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stk40Q7TNL3 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Stk40Q7TNL3 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.4 ms