Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMS5

Abcg2, ATP-binding cassette sub-family G member 2, mousemouse

Predictions only

Length 657 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg2Q7TMS5 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Abcg2Q7TMS5 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms