Protein–RNA interactions for Protein: Q7M6Y2

Sox11, Transcription factor SOX-11, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox11Q7M6Y2 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Sox11Q7M6Y2 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Sox11Q7M6Y2 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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