Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
ScocQ78YZ6 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
ScocQ78YZ6 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms