Protein–RNA interactions for Protein: Q78WZ7

Twistnb, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwistnbQ78WZ7 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TwistnbQ78WZ7 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TwistnbQ78WZ7 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TwistnbQ78WZ7 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TwistnbQ78WZ7 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TwistnbQ78WZ7 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TwistnbQ78WZ7 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TwistnbQ78WZ7 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TwistnbQ78WZ7 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TwistnbQ78WZ7 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TwistnbQ78WZ7 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
TwistnbQ78WZ7 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TwistnbQ78WZ7 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TwistnbQ78WZ7 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TwistnbQ78WZ7 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TwistnbQ78WZ7 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TwistnbQ78WZ7 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TwistnbQ78WZ7 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TwistnbQ78WZ7 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TwistnbQ78WZ7 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TwistnbQ78WZ7 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TwistnbQ78WZ7 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
TwistnbQ78WZ7 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TwistnbQ78WZ7 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TwistnbQ78WZ7 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TwistnbQ78WZ7 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TwistnbQ78WZ7 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TwistnbQ78WZ7 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TwistnbQ78WZ7 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TwistnbQ78WZ7 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TwistnbQ78WZ7 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TwistnbQ78WZ7 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TwistnbQ78WZ7 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TwistnbQ78WZ7 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TwistnbQ78WZ7 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TwistnbQ78WZ7 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TwistnbQ78WZ7 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TwistnbQ78WZ7 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TwistnbQ78WZ7 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TwistnbQ78WZ7 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TwistnbQ78WZ7 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TwistnbQ78WZ7 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TwistnbQ78WZ7 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TwistnbQ78WZ7 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TwistnbQ78WZ7 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TwistnbQ78WZ7 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TwistnbQ78WZ7 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
TwistnbQ78WZ7 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TwistnbQ78WZ7 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TwistnbQ78WZ7 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TwistnbQ78WZ7 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TwistnbQ78WZ7 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TwistnbQ78WZ7 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TwistnbQ78WZ7 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TwistnbQ78WZ7 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.04■□□□□ -0
TwistnbQ78WZ7 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TwistnbQ78WZ7 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TwistnbQ78WZ7 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TwistnbQ78WZ7 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TwistnbQ78WZ7 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TwistnbQ78WZ7 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
TwistnbQ78WZ7 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TwistnbQ78WZ7 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TwistnbQ78WZ7 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TwistnbQ78WZ7 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TwistnbQ78WZ7 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TwistnbQ78WZ7 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
TwistnbQ78WZ7 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TwistnbQ78WZ7 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
TwistnbQ78WZ7 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TwistnbQ78WZ7 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TwistnbQ78WZ7 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TwistnbQ78WZ7 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TwistnbQ78WZ7 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TwistnbQ78WZ7 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TwistnbQ78WZ7 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TwistnbQ78WZ7 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TwistnbQ78WZ7 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TwistnbQ78WZ7 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TwistnbQ78WZ7 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TwistnbQ78WZ7 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TwistnbQ78WZ7 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TwistnbQ78WZ7 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TwistnbQ78WZ7 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TwistnbQ78WZ7 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
TwistnbQ78WZ7 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TwistnbQ78WZ7 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TwistnbQ78WZ7 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TwistnbQ78WZ7 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TwistnbQ78WZ7 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.03■□□□□ -0
TwistnbQ78WZ7 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TwistnbQ78WZ7 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TwistnbQ78WZ7 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TwistnbQ78WZ7 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TwistnbQ78WZ7 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
TwistnbQ78WZ7 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TwistnbQ78WZ7 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TwistnbQ78WZ7 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
TwistnbQ78WZ7 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
TwistnbQ78WZ7 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms