Protein–RNA interactions for Protein: Q76I25

Higd1c, HIG1 domain family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1cQ76I25 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Higd1cQ76I25 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms