Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC11.83□□□□□ -0.51
Rph3alQ768S4 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Rph3alQ768S4 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
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