Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Topbp1Q6ZQF0 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Topbp1Q6ZQF0 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Topbp1Q6ZQF0 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Topbp1Q6ZQF0 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Topbp1Q6ZQF0 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Topbp1Q6ZQF0 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Topbp1Q6ZQF0 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Topbp1Q6ZQF0 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Topbp1Q6ZQF0 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Topbp1Q6ZQF0 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Topbp1Q6ZQF0 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Topbp1Q6ZQF0 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Topbp1Q6ZQF0 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Topbp1Q6ZQF0 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Topbp1Q6ZQF0 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Topbp1Q6ZQF0 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Topbp1Q6ZQF0 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Topbp1Q6ZQF0 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Topbp1Q6ZQF0 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Topbp1Q6ZQF0 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Topbp1Q6ZQF0 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Topbp1Q6ZQF0 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Topbp1Q6ZQF0 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Topbp1Q6ZQF0 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Topbp1Q6ZQF0 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Topbp1Q6ZQF0 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Topbp1Q6ZQF0 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Topbp1Q6ZQF0 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Topbp1Q6ZQF0 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Topbp1Q6ZQF0 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Topbp1Q6ZQF0 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Topbp1Q6ZQF0 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Topbp1Q6ZQF0 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Topbp1Q6ZQF0 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Topbp1Q6ZQF0 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Topbp1Q6ZQF0 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Topbp1Q6ZQF0 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Topbp1Q6ZQF0 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Topbp1Q6ZQF0 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Topbp1Q6ZQF0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Topbp1Q6ZQF0 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Topbp1Q6ZQF0 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Topbp1Q6ZQF0 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Topbp1Q6ZQF0 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Topbp1Q6ZQF0 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Topbp1Q6ZQF0 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Topbp1Q6ZQF0 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Topbp1Q6ZQF0 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Topbp1Q6ZQF0 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Topbp1Q6ZQF0 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Topbp1Q6ZQF0 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Topbp1Q6ZQF0 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Topbp1Q6ZQF0 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Topbp1Q6ZQF0 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Topbp1Q6ZQF0 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Topbp1Q6ZQF0 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Topbp1Q6ZQF0 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Topbp1Q6ZQF0 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Topbp1Q6ZQF0 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Topbp1Q6ZQF0 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Topbp1Q6ZQF0 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Topbp1Q6ZQF0 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Topbp1Q6ZQF0 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Topbp1Q6ZQF0 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Topbp1Q6ZQF0 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Topbp1Q6ZQF0 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Topbp1Q6ZQF0 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Topbp1Q6ZQF0 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Topbp1Q6ZQF0 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Topbp1Q6ZQF0 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Topbp1Q6ZQF0 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Topbp1Q6ZQF0 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Topbp1Q6ZQF0 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Topbp1Q6ZQF0 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Topbp1Q6ZQF0 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Topbp1Q6ZQF0 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Topbp1Q6ZQF0 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Topbp1Q6ZQF0 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Topbp1Q6ZQF0 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Topbp1Q6ZQF0 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Topbp1Q6ZQF0 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Topbp1Q6ZQF0 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Topbp1Q6ZQF0 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Topbp1Q6ZQF0 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Topbp1Q6ZQF0 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Topbp1Q6ZQF0 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Topbp1Q6ZQF0 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Topbp1Q6ZQF0 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Topbp1Q6ZQF0 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Topbp1Q6ZQF0 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Topbp1Q6ZQF0 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Topbp1Q6ZQF0 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Topbp1Q6ZQF0 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Topbp1Q6ZQF0 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Topbp1Q6ZQF0 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Topbp1Q6ZQF0 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Topbp1Q6ZQF0 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Topbp1Q6ZQF0 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Topbp1Q6ZQF0 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms