Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS4

Ssxb3, SSXB3 protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb3Q6XAS4 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssxb3Q6XAS4 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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