Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS3

Ssx9, MCG116991, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssx9Q6XAS3 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ssx9Q6XAS3 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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